More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3559 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  58.72 
 
 
1127 aa  860    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  100 
 
 
997 aa  2026    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  47.46 
 
 
1053 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  48.86 
 
 
1146 aa  814    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  57.98 
 
 
855 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  58.58 
 
 
1127 aa  857    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  54.49 
 
 
1129 aa  854    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  58.72 
 
 
1127 aa  858    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  58.11 
 
 
904 aa  849    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  66.91 
 
 
772 aa  943    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  47.85 
 
 
1051 aa  771    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  51.49 
 
 
1127 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  46.73 
 
 
1054 aa  769    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  45.48 
 
 
760 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.41 
 
 
762 aa  252  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  30.12 
 
 
854 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 
484 aa  229  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  29.04 
 
 
703 aa  179  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 
674 aa  178  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.51 
 
 
674 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.51 
 
 
674 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.51 
 
 
674 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.51 
 
 
674 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.4 
 
 
674 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.51 
 
 
674 aa  173  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.26 
 
 
674 aa  173  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.26 
 
 
674 aa  172  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 
674 aa  172  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  27.94 
 
 
674 aa  168  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.66 
 
 
372 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  27.12 
 
 
634 aa  156  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 
652 aa  150  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  40 
 
 
613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  27.45 
 
 
482 aa  149  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.66 
 
 
431 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  26.54 
 
 
639 aa  144  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.15 
 
 
848 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.82 
 
 
848 aa  131  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  27.84 
 
 
855 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.9 
 
 
552 aa  124  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  31.16 
 
 
662 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  28.88 
 
 
1271 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  27.6 
 
 
652 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  25.43 
 
 
382 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  25.26 
 
 
868 aa  115  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 
868 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  23.85 
 
 
499 aa  112  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.83 
 
 
867 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29.05 
 
 
505 aa  110  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  43.37 
 
 
743 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  29.31 
 
 
869 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  29.3 
 
 
398 aa  109  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 
868 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.58 
 
 
1132 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  36.61 
 
 
514 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  28.39 
 
 
868 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  21.74 
 
 
1443 aa  106  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  29.08 
 
 
868 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  25.6 
 
 
559 aa  106  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
1246 aa  104  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  39.29 
 
 
1887 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  38 
 
 
2286 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
1782 aa  101  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.41 
 
 
973 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.97 
 
 
396 aa  101  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  31.23 
 
 
532 aa  101  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  36.32 
 
 
562 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  28.62 
 
 
521 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.73 
 
 
6885 aa  100  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.08 
 
 
729 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  27.73 
 
 
455 aa  99  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  25.15 
 
 
414 aa  98.2  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.98 
 
 
455 aa  97.8  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  30.27 
 
 
763 aa  96.3  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  39.7 
 
 
2170 aa  95.1  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  31.62 
 
 
675 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30.51 
 
 
651 aa  94.7  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  28.2 
 
 
401 aa  94.7  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
458 aa  94.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.52 
 
 
455 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.41 
 
 
455 aa  93.2  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  35.61 
 
 
459 aa  93.2  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  29.75 
 
 
536 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33 
 
 
455 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33 
 
 
455 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  27.06 
 
 
586 aa  92  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  26.51 
 
 
463 aa  92  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  27.37 
 
 
373 aa  92  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  27.87 
 
 
377 aa  91.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.51 
 
 
455 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  36.08 
 
 
458 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 
355 aa  90.5  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  27.79 
 
 
563 aa  90.9  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  27.27 
 
 
868 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.56 
 
 
407 aa  90.1  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  28.53 
 
 
540 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  89.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  24.93 
 
 
1776 aa  89.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.33 
 
 
456 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  32.81 
 
 
455 aa  89.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>