More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3507 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  762    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  68.83 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  62.79 
 
 		 412 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 416 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  33.18 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.34 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 396 aa  113  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10859  integral membrane protein  32.3 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000464176 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  27.04 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.34 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.88 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.76 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 417 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 424 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.27 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  27.87 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  25.28 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.98 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.43 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  21.57 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.93 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.93 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.93 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.93 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  25 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  25 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.93 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  24.86 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.93 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.93 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.72 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.66 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  25 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.06 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  30.52 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.93 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  24.25 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.86 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.72 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  24.15 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  24.43 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.72 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.51 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.51 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.87 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.58 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  20 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>