More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3472 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  100 
 
 
564 aa  1066    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  59.1 
 
 
549 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  51.62 
 
 
570 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
575 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  47.12 
 
 
587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.05 
 
 
619 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38.89 
 
 
566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
560 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  41.4 
 
 
584 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  34.77 
 
 
612 aa  233  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  36.16 
 
 
615 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  36.11 
 
 
575 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
570 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
574 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  34.93 
 
 
564 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  36.31 
 
 
578 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  37.72 
 
 
578 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  27.43 
 
 
581 aa  213  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  34.16 
 
 
581 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.42 
 
 
597 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.36 
 
 
607 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.24 
 
 
598 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
581 aa  193  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  32.62 
 
 
721 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  30.2 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  31.82 
 
 
726 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.3 
 
 
1257 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  28.31 
 
 
588 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.07 
 
 
608 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  33.57 
 
 
593 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 
579 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.73 
 
 
1194 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
619 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  29.46 
 
 
784 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.74 
 
 
588 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.64 
 
 
1284 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  26.99 
 
 
578 aa  187  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.58 
 
 
600 aa  187  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.13 
 
 
605 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.86 
 
 
616 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  25.26 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  26.49 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  25.32 
 
 
577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  27.27 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.32 
 
 
575 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  24.63 
 
 
588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.02 
 
 
611 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.71 
 
 
619 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  36.25 
 
 
1321 aa  183  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  31.19 
 
 
764 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  29.65 
 
 
594 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34 
 
 
618 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  26.94 
 
 
589 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  28.8 
 
 
601 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.73 
 
 
600 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  26.39 
 
 
592 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.78 
 
 
618 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.6 
 
 
580 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.03 
 
 
622 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.64 
 
 
601 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.23 
 
 
580 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  29.18 
 
 
606 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  24.68 
 
 
590 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  30.37 
 
 
773 aa  180  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  27.02 
 
 
601 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  31.71 
 
 
599 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.4 
 
 
625 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.1 
 
 
603 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  25.37 
 
 
601 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  32.81 
 
 
1522 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  30.67 
 
 
634 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  29.27 
 
 
596 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  30.9 
 
 
589 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.15 
 
 
583 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  29.7 
 
 
808 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  27.15 
 
 
583 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  27.15 
 
 
583 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  27.95 
 
 
595 aa  177  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  24.21 
 
 
581 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.15 
 
 
583 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.91 
 
 
720 aa  177  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  29.18 
 
 
619 aa  177  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  26.82 
 
 
589 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1062  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.31 
 
 
598 aa  176  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.9 
 
 
598 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  25.93 
 
 
588 aa  176  9e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  34.47 
 
 
1436 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  27.15 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  28.63 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  32.09 
 
 
613 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  33.13 
 
 
1218 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  24.89 
 
 
594 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  25.93 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.22 
 
 
628 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  27.46 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.75 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.54 
 
 
600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.33 
 
 
741 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  25 
 
 
601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>