14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3402 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3402  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  0.301913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  32.93 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  33.92 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  29.27 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  33.74 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  32.64 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  32.72 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  32.72 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  31.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  29.24 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  26.95 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  31.29 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  26.92 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  30.12 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>