30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3362 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  213  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  47.12 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  49.04 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  48.35 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  51 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  47.12 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  47.12 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  47.12 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  43.96 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  53.06 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  43.88 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  42.45 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  45.63 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  44 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.54 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  45.92 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.34 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.9 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  44.34 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  45.92 
 
 		 277 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  41.12 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  41.51 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.91 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  41 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  38.83 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  38.2 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  34.21 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>