More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3353 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 483 aa  954    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  58.56 
 
 		 495 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  50.83 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  50.21 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 		 597 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  49.68 
 
 		 480 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  49.58 
 
 		 483 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  50.42 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  50.8 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  50.52 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  49.79 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  48.14 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  50 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  50.96 
 
 		 514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  50.33 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.9 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  34.41 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.91 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.06 
 
 		 477 aa  127  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.36 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 463 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 485 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 462 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  27.6 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  27.6 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.79 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  27.38 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.72 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  27.39 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.18 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 470 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30 
 
 		 462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  28.12 
 
 		 477 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.44 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>