More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3338 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  52.35 
 
 		 1975 aa  832    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.41 
 
 		 1248 aa  756    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  40.92 
 
 		 1328 aa  705    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.71 
 
 		 2156 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.75 
 
 		 1035 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.25 
 
 		 1855 aa  1664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.01 
 
 		 1117 aa  927    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  45.9 
 
 		 991 aa  827    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  52.22 
 
 		 1331 aa  883    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  100 
 
 		 1942 aa  3927    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  52.66 
 
 		 1891 aa  774    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  55.15 
 
 		 1017 aa  789    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.35 
 
 		 891 aa  805    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  54.51 
 
 		 1005 aa  767    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  57.65 
 
 		 1025 aa  974    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  50.17 
 
 		 2068 aa  763    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  55.69 
 
 		 925 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  52.57 
 
 		 1176 aa  863    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  40.4 
 
 		 1329 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  43.1 
 
 		 1062 aa  720    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  61.19 
 
 		 946 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.99 
 
 		 1124 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.01 
 
 		 1441 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.13 
 
 		 1440 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.13 
 
 		 1440 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  37.6 
 
 		 998 aa  582  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  35.41 
 
 		 1432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  34.95 
 
 		 1429 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  34.58 
 
 		 1472 aa  555  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  44.57 
 
 		 717 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.66 
 
 		 1450 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  48.14 
 
 		 609 aa  526  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  47.89 
 
 		 600 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  49.81 
 
 		 614 aa  485  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  42.14 
 
 		 599 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  43.67 
 
 		 723 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  45.5 
 
 		 622 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  42.74 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  46.14 
 
 		 604 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  29.95 
 
 		 874 aa  339  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.01 
 
 		 852 aa  312  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  29.7 
 
 		 852 aa  309  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  29.7 
 
 		 852 aa  309  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  29.89 
 
 		 850 aa  309  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  29.65 
 
 		 852 aa  308  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  32.42 
 
 		 1043 aa  303  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  29.48 
 
 		 848 aa  303  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  31.43 
 
 		 647 aa  303  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  29.31 
 
 		 655 aa  296  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  29.4 
 
 		 848 aa  294  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  28.13 
 
 		 856 aa  291  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  29.21 
 
 		 655 aa  290  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.41 
 
 		 2638 aa  290  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  29.04 
 
 		 852 aa  288  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.21 
 
 		 842 aa  287  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  30.07 
 
 		 1136 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  28.86 
 
 		 852 aa  286  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  26.77 
 
 		 899 aa  280  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.15 
 
 		 843 aa  273  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  30.58 
 
 		 640 aa  266  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.27 
 
 		 843 aa  264  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.68 
 
 		 1888 aa  264  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  26.18 
 
 		 1064 aa  258  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  26.61 
 
 		 1064 aa  258  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  26.17 
 
 		 841 aa  254  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  28.13 
 
 		 825 aa  249  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.65 
 
 		 713 aa  244  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.4 
 
 		 713 aa  244  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.4 
 
 		 713 aa  244  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  32.92 
 
 		 601 aa  242  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  27.34 
 
 		 713 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  27.22 
 
 		 713 aa  240  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  27.65 
 
 		 713 aa  239  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  27.34 
 
 		 713 aa  239  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  27.96 
 
 		 928 aa  236  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  27.38 
 
 		 713 aa  235  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  29.98 
 
 		 669 aa  234  9e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.41 
 
 		 718 aa  233  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  27 
 
 		 713 aa  231  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  27.1 
 
 		 713 aa  230  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.35 
 
 		 712 aa  223  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  31.73 
 
 		 620 aa  214  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  26.56 
 
 		 640 aa  210  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.76 
 
 		 766 aa  209  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  31.55 
 
 		 838 aa  204  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  24.58 
 
 		 1252 aa  200  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  28.06 
 
 		 776 aa  199  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  29.38 
 
 		 885 aa  196  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.79 
 
 		 836 aa  196  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.61 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.74 
 
 		 511 aa  189  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  29 
 
 		 814 aa  186  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.81 
 
 		 524 aa  183  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 		 528 aa  172  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 528 aa  171  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  29.66 
 
 		 526 aa  169  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.57 
 
 		 564 aa  163  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  29.18 
 
 		 617 aa  161  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  29.48 
 
 		 624 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  26.85 
 
 		 617 aa  159  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>