More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3240 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  58.29 
 
 
219 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  55.61 
 
 
217 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
200 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  36.93 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 
216 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
207 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  31.82 
 
 
190 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.33 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  34.23 
 
 
204 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 
191 aa  61.6  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
231 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
212 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  31.18 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
194 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  25.32 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
210 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
210 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
201 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
207 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
210 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
248 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.06 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
231 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
275 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  32.73 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  23.12 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>