43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3220 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  48.25 
 
 
146 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  43.07 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  38.85 
 
 
143 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  42.96 
 
 
136 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  38.73 
 
 
141 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  40.58 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  42.65 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  42.65 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  42.65 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  39.71 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  38.41 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  40.71 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  39.13 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  37.14 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.06 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  33.86 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  30.65 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  30.65 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  30.65 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  32.19 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  37.84 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  34.52 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  31.37 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  28.89 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  26.53 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.62 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  27.86 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  29.77 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4387  hypothetical protein  30.68 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  25.93 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  28.92 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  29.77 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  29.77 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>