More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3200 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 395 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.3 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.89 
 
 		 442 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  42.72 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  40.17 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.14 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40.06 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  38.64 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  48.42 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  43.89 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  45.85 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  44.98 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  40.07 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  47.85 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.55 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  37.57 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  46.89 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 586 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  34.94 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 417 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  48.08 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 624 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  41.39 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.96 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  42.17 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  47.62 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.12 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.54 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  40.89 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  45.06 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  45.62 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  47.37 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  40.8 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  45.26 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  42.98 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  44.31 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 570 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 621 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  41.9 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.64 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  30.81 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 587 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  40.76 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  38.97 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 725 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  39.61 
 
 		 580 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  37.76 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 565 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  36.51 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.17 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.62 
 
 		 325 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  35.65 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 709 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 470 aa  96.3  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.98 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 618 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 595 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 535 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 440 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 731 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 723 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>