120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3181 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  100 
 
 
1150 aa  2305    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  32.14 
 
 
2216 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.67 
 
 
951 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  32.66 
 
 
1237 aa  222  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  31.94 
 
 
1349 aa  218  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.31 
 
 
798 aa  217  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.31 
 
 
1004 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  32.02 
 
 
1339 aa  214  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  29.79 
 
 
1345 aa  212  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  34.13 
 
 
2194 aa  211  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.83 
 
 
942 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  31.67 
 
 
783 aa  205  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  31 
 
 
1742 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.75 
 
 
1148 aa  157  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  40.88 
 
 
394 aa  118  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  24.64 
 
 
1492 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.63 
 
 
649 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  25.43 
 
 
773 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.88 
 
 
762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.75 
 
 
805 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.83 
 
 
1067 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.88 
 
 
762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.98 
 
 
766 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.68 
 
 
997 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.24 
 
 
801 aa  108  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.24 
 
 
1044 aa  108  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  28.01 
 
 
1002 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24.36 
 
 
799 aa  106  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  27.46 
 
 
1049 aa  105  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  24.52 
 
 
1053 aa  103  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.62 
 
 
725 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  26.05 
 
 
923 aa  102  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  23.95 
 
 
1267 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  48.94 
 
 
419 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.95 
 
 
1216 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.18 
 
 
1086 aa  90.9  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  25.71 
 
 
1064 aa  89.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  24.05 
 
 
818 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.46 
 
 
908 aa  89  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  26.41 
 
 
1201 aa  86.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  26.82 
 
 
1080 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.08 
 
 
1091 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.25 
 
 
1183 aa  84  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.48 
 
 
1044 aa  83.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  52.44 
 
 
100 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  26.5 
 
 
1049 aa  83.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  39.58 
 
 
457 aa  83.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.79 
 
 
570 aa  81.6  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  25.43 
 
 
960 aa  81.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.9 
 
 
1330 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.06 
 
 
1041 aa  81.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.41 
 
 
852 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.34 
 
 
1186 aa  79.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  25.38 
 
 
1190 aa  79  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  25.94 
 
 
1581 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.32 
 
 
1023 aa  78.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.48 
 
 
1174 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  29.34 
 
 
353 aa  76.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.57 
 
 
951 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  29.71 
 
 
1106 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.5 
 
 
914 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  23.62 
 
 
965 aa  72  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  25.44 
 
 
1007 aa  69.7  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  26.05 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  27.46 
 
 
969 aa  68.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  28.65 
 
 
334 aa  67.4  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.87 
 
 
944 aa  65.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  25.42 
 
 
1335 aa  65.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.62 
 
 
887 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  23.08 
 
 
334 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.49 
 
 
1475 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  30.82 
 
 
334 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  23.46 
 
 
1282 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  33.1 
 
 
280 aa  61.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  25.67 
 
 
595 aa  60.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  30.85 
 
 
447 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1483  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.26 
 
 
636 aa  61.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  33.67 
 
 
684 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  39.18 
 
 
1427 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  26.11 
 
 
397 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  26.03 
 
 
447 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.86 
 
 
911 aa  58.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  31.13 
 
 
373 aa  58.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.39 
 
 
1343 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  23.97 
 
 
647 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  31.96 
 
 
342 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  30.93 
 
 
323 aa  55.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8620  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.49 
 
 
1239 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00545608  normal  0.590106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  27.01 
 
 
346 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  21.43 
 
 
1073 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.16 
 
 
872 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.51 
 
 
1766 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  27.23 
 
 
333 aa  52.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0119  signal transduction protein  33.59 
 
 
1075 aa  52.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.955952 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.82 
 
 
949 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.5 
 
 
1094 aa  52  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.19 
 
 
880 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  21.79 
 
 
625 aa  51.6  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.19 
 
 
880 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.07 
 
 
1901 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>