More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3160 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  100 
 
 
421 aa  855    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  56.8 
 
 
429 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  56.47 
 
 
435 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  56 
 
 
432 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  54.46 
 
 
462 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  55.06 
 
 
440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  54.12 
 
 
433 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  55.16 
 
 
442 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  52.48 
 
 
452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  53.07 
 
 
440 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  52.34 
 
 
434 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  53.04 
 
 
434 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  50 
 
 
434 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  50.23 
 
 
446 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  52.21 
 
 
442 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  52.79 
 
 
444 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  50.93 
 
 
443 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  50.93 
 
 
438 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  49.65 
 
 
439 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  47.42 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  47.66 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  51.14 
 
 
468 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  50.58 
 
 
441 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  52.24 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  48.59 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  48.59 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  50.81 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  50.47 
 
 
444 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  49.07 
 
 
441 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  52.13 
 
 
468 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  49.19 
 
 
443 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  47.93 
 
 
437 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  48.04 
 
 
450 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  47.48 
 
 
448 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  45.2 
 
 
449 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  46.88 
 
 
444 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  46.88 
 
 
444 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  46.88 
 
 
444 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  46.56 
 
 
446 aa  362  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  45.03 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  44.95 
 
 
451 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  45.54 
 
 
430 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  33.42 
 
 
473 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.26 
 
 
434 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  28.97 
 
 
478 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.49 
 
 
469 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.19 
 
 
477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  30.16 
 
 
493 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  28.89 
 
 
468 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.03 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.41 
 
 
493 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  29.33 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.77 
 
 
472 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.6 
 
 
497 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  31.93 
 
 
489 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  26.67 
 
 
477 aa  135  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  29 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.61 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  30.08 
 
 
549 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.61 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 
433 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  26.34 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  26.84 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.25 
 
 
485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  27.61 
 
 
494 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  32.03 
 
 
510 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  28.64 
 
 
465 aa  119  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  27.34 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.95 
 
 
507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.95 
 
 
507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  28.76 
 
 
490 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  26.84 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  29.27 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.72 
 
 
476 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  30.65 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.62 
 
 
390 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.26 
 
 
508 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.38 
 
 
373 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.05 
 
 
396 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 
387 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  28.18 
 
 
396 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 
395 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  28.1 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  27.01 
 
 
407 aa  96.7  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.41 
 
 
423 aa  96.3  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  26.91 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  25.94 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  27.35 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.29 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  28.03 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  25.81 
 
 
483 aa  89.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>