More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3010 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
737 aa  1501    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.32 
 
 
759 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  62.53 
 
 
744 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  75 
 
 
736 aa  1000    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  63.85 
 
 
739 aa  891    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  56.05 
 
 
1057 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  50 
 
 
773 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  47.35 
 
 
801 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  44.92 
 
 
892 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  45.47 
 
 
789 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.08 
 
 
747 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  42.77 
 
 
820 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  42.14 
 
 
740 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  41.14 
 
 
880 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
807 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 
819 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  39.65 
 
 
871 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
877 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  38.77 
 
 
784 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  40.21 
 
 
821 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  37.91 
 
 
727 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
758 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 
758 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.82 
 
 
833 aa  369  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.73 
 
 
763 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  37.21 
 
 
721 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
705 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
766 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  35.46 
 
 
807 aa  351  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  37.89 
 
 
726 aa  351  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
723 aa  351  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  36.8 
 
 
771 aa  350  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
710 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  36.66 
 
 
765 aa  348  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
710 aa  347  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.11 
 
 
727 aa  333  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
766 aa  331  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  35.68 
 
 
814 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
808 aa  330  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.9 
 
 
772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  35.67 
 
 
680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.67 
 
 
817 aa  328  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
801 aa  324  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.59 
 
 
821 aa  323  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 
703 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  33.87 
 
 
768 aa  313  6.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  35.12 
 
 
838 aa  312  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 
695 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  35.12 
 
 
693 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 
700 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  32.91 
 
 
830 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  34.59 
 
 
773 aa  300  8e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
840 aa  293  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.86 
 
 
722 aa  287  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 
828 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.98 
 
 
720 aa  280  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.49 
 
 
648 aa  280  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.94 
 
 
710 aa  278  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
811 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  35.6 
 
 
750 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.08 
 
 
643 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 
761 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
1065 aa  270  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
818 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.6 
 
 
761 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 
643 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 
643 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
816 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
831 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
831 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
817 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
830 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.13 
 
 
810 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 
816 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
816 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
816 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
1245 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.22 
 
 
776 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
824 aa  257  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.39 
 
 
806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.97 
 
 
640 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 
714 aa  253  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.67 
 
 
649 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.83 
 
 
712 aa  252  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.56 
 
 
661 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.25 
 
 
824 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.17 
 
 
824 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.73 
 
 
723 aa  250  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  31.83 
 
 
828 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.7 
 
 
618 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 
755 aa  247  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.51 
 
 
765 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.97 
 
 
710 aa  244  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.57 
 
 
761 aa  244  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3392  glycosyl transferase family 51  34.68 
 
 
662 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.305722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.26 
 
 
654 aa  242  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 
727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.04 
 
 
714 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
695 aa  239  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
764 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>