More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2855 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
252 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  69.04 
 
 
245 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  59.92 
 
 
257 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  59 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  50.81 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  54.01 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  53.57 
 
 
252 aa  194  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  47.76 
 
 
252 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  51.21 
 
 
249 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  49.05 
 
 
265 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  49.19 
 
 
270 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  53.27 
 
 
243 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  52.42 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  44.6 
 
 
262 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  45.75 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  42.38 
 
 
250 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 
267 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  33.76 
 
 
267 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 
267 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 
267 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  31.02 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  32.1 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  28.84 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  32.79 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  37.25 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  33.63 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  32.48 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  30.58 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  33.19 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  31.12 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  34.44 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  30.71 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  27.5 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  33.33 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  29.17 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  30.71 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  32.43 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  34.98 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  34.69 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  31.69 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  34.98 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  25.39 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  33.54 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  28.63 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  28.63 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  31.02 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  28.63 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
269 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  33.62 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  28.27 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  23.32 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  25.91 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  33.5 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  23.48 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  24.51 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  32.77 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  32.12 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.84 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  26.86 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.82 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  24.89 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  22.62 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  43.7 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.06 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  33 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  27.48 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.34 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  34.74 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.03 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.43 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.69 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.81 
 
 
275 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>