43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2851 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1244    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  48.73 
 
 		 653 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  25.96 
 
 		 815 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  27.22 
 
 		 1076 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  26.93 
 
 		 906 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.84 
 
 		 621 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  24.24 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 707 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  25.55 
 
 		 880 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  23.87 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 742 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.25 
 
 		 665 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  29.5 
 
 		 1452 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  24.79 
 
 		 854 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  22.58 
 
 		 737 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  25.25 
 
 		 990 aa  50.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  25.27 
 
 		 578 aa  50.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  27.92 
 
 		 864 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 739 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  23.54 
 
 		 1759 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  21.93 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  21 
 
 		 874 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.18 
 
 		 571 aa  47.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  21.14 
 
 		 778 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  21.81 
 
 		 686 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33.52 
 
 		 984 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  31.4 
 
 		 1369 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.13 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.16 
 
 		 2042 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  22.68 
 
 		 736 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  25.7 
 
 		 833 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  29.05 
 
 		 875 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  24.06 
 
 		 613 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.41 
 
 		 998 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  25.32 
 
 		 591 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.32 
 
 		 867 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  25.15 
 
 		 725 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  22.31 
 
 		 885 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  26.92 
 
 		 775 aa  43.9  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  25.6 
 
 		 847 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  25.78 
 
 		 739 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>