More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2766 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  100 
 
 
427 aa  831    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  52.09 
 
 
436 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  50.94 
 
 
436 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  51.57 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  50.98 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  51.57 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  51.67 
 
 
437 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  50.98 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  51.67 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  50.73 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  50.73 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  51.93 
 
 
470 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  49.53 
 
 
443 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  51.33 
 
 
434 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
443 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
443 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
443 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
443 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  50.59 
 
 
469 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  52.58 
 
 
437 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  52.58 
 
 
437 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  48.82 
 
 
443 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  49.06 
 
 
443 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  52.64 
 
 
468 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  51.57 
 
 
481 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  51.06 
 
 
439 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  51.3 
 
 
444 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  51.3 
 
 
444 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  51.33 
 
 
474 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  55.16 
 
 
437 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  51.3 
 
 
444 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  51.65 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  51.3 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  51.56 
 
 
524 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  55.16 
 
 
437 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  51.3 
 
 
444 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  51.3 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  55.16 
 
 
437 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  51.3 
 
 
444 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  55.16 
 
 
437 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  51.65 
 
 
457 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  55.16 
 
 
437 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  51.42 
 
 
457 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  51.42 
 
 
444 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  48.8 
 
 
446 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  51.06 
 
 
439 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  50.84 
 
 
470 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  50.36 
 
 
443 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  51.42 
 
 
457 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  50.84 
 
 
470 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  47.99 
 
 
468 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  51.42 
 
 
439 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  50.84 
 
 
470 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  50.36 
 
 
471 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  50.4 
 
 
433 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  47.6 
 
 
441 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  47.6 
 
 
441 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  48.77 
 
 
433 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  46.88 
 
 
441 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  47.6 
 
 
441 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  49.41 
 
 
439 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  46.88 
 
 
441 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  48.08 
 
 
441 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 
434 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  50.48 
 
 
439 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 
432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.47 
 
 
441 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.53 
 
 
468 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  46.72 
 
 
450 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  47.31 
 
 
441 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.69 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  50.13 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  50.13 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  46.06 
 
 
433 aa  308  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  45.39 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  43.82 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.35 
 
 
430 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.72 
 
 
446 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.93 
 
 
437 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.67 
 
 
439 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40.52 
 
 
455 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  47.96 
 
 
430 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.67 
 
 
439 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.09 
 
 
439 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.09 
 
 
439 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  43.9 
 
 
450 aa  295  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.93 
 
 
437 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.8 
 
 
442 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.42 
 
 
439 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
431 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.16 
 
 
439 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.16 
 
 
439 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  44.07 
 
 
438 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1014  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
444 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  44.6 
 
 
439 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  44.6 
 
 
439 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>