More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2764 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 518 aa  958    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  45.12 
 
 		 499 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  43.93 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  41.59 
 
 		 505 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  41.74 
 
 		 488 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  40.76 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  40.99 
 
 		 546 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  39.39 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  41.28 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  37.27 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  40.68 
 
 		 546 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  38.15 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  38.05 
 
 		 580 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  41.74 
 
 		 580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  39.87 
 
 		 591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  44.34 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  38.87 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  29.74 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.21 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  29.89 
 
 		 516 aa  156  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  51.45 
 
 		 573 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  28.99 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.06 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  28.99 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  42.27 
 
 		 562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  29.66 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  29.66 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  29.66 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  29.01 
 
 		 516 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  29.24 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  29.96 
 
 		 559 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  29.67 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  27.54 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 584 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  43.23 
 
 		 578 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  43.23 
 
 		 578 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  43.23 
 
 		 578 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  26.3 
 
 		 584 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  29.24 
 
 		 563 aa  146  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  33.77 
 
 		 693 aa  146  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  32.99 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.49 
 
 		 554 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.24 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  28.79 
 
 		 584 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  29.29 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  29.66 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  27.22 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  30.32 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  31.57 
 
 		 563 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  31.57 
 
 		 563 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  29.18 
 
 		 557 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5644  Na+/solute symporter  29.64 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  28.51 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  28.09 
 
 		 552 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.38 
 
 		 563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.66 
 
 		 515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.08 
 
 		 539 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  28.95 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.06 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.38 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  27.5 
 
 		 549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  26.73 
 
 		 552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  27.79 
 
 		 549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  27.79 
 
 		 549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  29.17 
 
 		 661 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  26.73 
 
 		 552 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  30.22 
 
 		 554 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  30.33 
 
 		 561 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.33 
 
 		 561 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  27.5 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  27.5 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  27.5 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  27.5 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  27.5 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  28.29 
 
 		 549 aa  133  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  28.57 
 
 		 554 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  28.6 
 
 		 561 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  30.46 
 
 		 509 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.85 
 
 		 659 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  29.12 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  28.19 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  28.6 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  27.31 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  28.6 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  28.09 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  27.22 
 
 		 541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.78 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  27.07 
 
 		 584 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  27.53 
 
 		 661 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7091  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.08 
 
 		 557 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  27.16 
 
 		 554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  26.01 
 
 		 537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  26.07 
 
 		 546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  27.37 
 
 		 554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  27.16 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  26.83 
 
 		 552 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  27.16 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  27.9 
 
 		 550 aa  130  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  27.63 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>