82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2716 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  100 
 
 
229 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  65.46 
 
 
233 aa  222  5e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.68254e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  34.3 
 
 
266 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  30.4 
 
 
232 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  31.74 
 
 
232 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  31.2 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  30.09 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  34.36 
 
 
239 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  31.25 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  32.33 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  32.33 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  34.06 
 
 
223 aa  84.3  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  31.44 
 
 
240 aa  84  2e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  35.81 
 
 
226 aa  83.2  3e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  36 
 
 
226 aa  83.2  3e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  32.33 
 
 
227 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  31.44 
 
 
238 aa  80.1  3e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  34.21 
 
 
227 aa  79.3  5e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  34.98 
 
 
226 aa  75.5  7e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
231 aa  74.7  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.24 
 
 
240 aa  74.3  1e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  26.99 
 
 
240 aa  73.9  2e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25 
 
 
228 aa  68.9  6e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
228 aa  68.9  6e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  29.31 
 
 
243 aa  68.6  9e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  30.99 
 
 
240 aa  68.2  1e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  28.93 
 
 
243 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  31.46 
 
 
241 aa  65.1  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  23.08 
 
 
229 aa  62.4  6e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  23.08 
 
 
229 aa  62.4  6e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  22.27 
 
 
235 aa  61.6  1e-08  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  30.84 
 
 
240 aa  60.8  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  28.26 
 
 
231 aa  60.1  3e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  33.19 
 
 
225 aa  59.3  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  27.78 
 
 
229 aa  57.8  1e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 
230 aa  58.2  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  24.09 
 
 
199 aa  58.2  1e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  22.32 
 
 
229 aa  57  2e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
210 aa  56.6  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
210 aa  56.6  3e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  25.76 
 
 
230 aa  56.2  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  26.69 
 
 
221 aa  55.8  5e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  29.57 
 
 
210 aa  54.7  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  33.03 
 
 
218 aa  53.9  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  29.91 
 
 
210 aa  53.5  2e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
247 aa  53.1  4e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  21.55 
 
 
232 aa  53.1  4e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  22.41 
 
 
237 aa  52.4  5e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
224 aa  51.2  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
230 aa  51.2  1e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  33.61 
 
 
244 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  24.88 
 
 
227 aa  49.7  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  30.34 
 
 
225 aa  49.3  5e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  33.02 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  29.91 
 
 
237 aa  48.9  6e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  27.43 
 
 
235 aa  48.5  9e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  26.34 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  35.75 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  32.43 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.77 
 
 
225 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  28.89 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  29.07 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  30.94 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  27.73 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  29.33 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  29.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  29.69 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  30.21 
 
 
288 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  26.8 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  27.62 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  28.09 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  28.82 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  28.02 
 
 
309 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  27.97 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.24 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  31.05 
 
 
239 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
233 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>