More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2692 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  100 
 
 
162 aa  323  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  56.03 
 
 
236 aa  153  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  61.98 
 
 
160 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  53.45 
 
 
306 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  52.14 
 
 
331 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  50 
 
 
340 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  53.91 
 
 
235 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  53.1 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  49.58 
 
 
349 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
334 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  51.28 
 
 
417 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  52.29 
 
 
345 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
340 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  51.28 
 
 
459 aa  117  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.88 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
333 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
319 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.04 
 
 
332 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  50.55 
 
 
366 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  50.94 
 
 
501 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
337 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.97 
 
 
337 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.28 
 
 
321 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  50.43 
 
 
293 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  46.96 
 
 
374 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.61 
 
 
438 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  53.41 
 
 
333 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.57 
 
 
373 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  48.11 
 
 
517 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.03 
 
 
204 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.34 
 
 
176 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
308 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
452 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.7 
 
 
453 aa  104  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  47.46 
 
 
342 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  48.51 
 
 
348 aa  103  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
394 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  48 
 
 
347 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  48.08 
 
 
315 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.72 
 
 
224 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
223 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
223 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  49.47 
 
 
350 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
223 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  47.54 
 
 
223 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
223 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  47.75 
 
 
392 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
446 aa  100  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  45.87 
 
 
327 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.62 
 
 
232 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
224 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.94 
 
 
257 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.53 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  48.62 
 
 
337 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
524 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  45.1 
 
 
378 aa  99  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  45.9 
 
 
234 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  45.9 
 
 
234 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  47.75 
 
 
366 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
388 aa  98.2  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  45.9 
 
 
218 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  45.9 
 
 
218 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  45.9 
 
 
234 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  45.9 
 
 
218 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  45.9 
 
 
218 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
432 aa  97.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  47.75 
 
 
347 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
378 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.63 
 
 
372 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
372 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.5 
 
 
388 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
398 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
301 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  39.07 
 
 
367 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
372 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  54.65 
 
 
335 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  45.54 
 
 
393 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.27 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  45.95 
 
 
368 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.11 
 
 
400 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45 
 
 
393 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45.08 
 
 
234 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
221 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.16 
 
 
531 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
223 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  40.57 
 
 
227 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.26 
 
 
221 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
323 aa  95.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41 
 
 
368 aa  94.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  46 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.74 
 
 
273 aa  94.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
234 aa  94.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  40.68 
 
 
197 aa  94.4  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
230 aa  94.4  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 
275 aa  94  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
271 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 
271 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 
271 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 
271 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
271 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>