30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2684 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  845    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  71.98 
 
 		 437 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  58.35 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  53.12 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  52.53 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  52.97 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  47.49 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  45.48 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  46.54 
 
 		 519 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  47.14 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  42 
 
 		 507 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  41.51 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  37.15 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  39.25 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  52.46 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  35.43 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  27.56 
 
 		 174 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  27.56 
 
 		 174 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  28.35 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  34.15 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  37.4 
 
 		 181 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  27.18 
 
 		 168 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  33.05 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  34.17 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  29.77 
 
 		 177 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  29.06 
 
 		 164 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  34.75 
 
 		 169 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  31.34 
 
 		 180 aa  43.1  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.495635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>