More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2661 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  100 
 
 
1098 aa  2162    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.73 
 
 
1147 aa  864    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
1138 aa  949    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
1100 aa  1100    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 
1113 aa  962    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
1111 aa  1003    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
1101 aa  1025    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
1112 aa  1003    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
1172 aa  982    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
1120 aa  884    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
1112 aa  1003    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
1100 aa  1011    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
1094 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
496 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 
506 aa  575  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
500 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
500 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
499 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
499 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
501 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
528 aa  505  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
502 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
502 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
503 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
504 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
516 aa  469  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
512 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
512 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
510 aa  452  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  45.78 
 
 
592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
503 aa  446  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
500 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.69 
 
 
502 aa  442  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
515 aa  439  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.95 
 
 
510 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  45.52 
 
 
565 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
505 aa  432  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
520 aa  428  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
501 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
504 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
560 aa  419  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
1118 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
509 aa  410  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
497 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
489 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
573 aa  393  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  53.07 
 
 
578 aa  392  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
491 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
573 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
488 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42 
 
 
771 aa  388  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
509 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  48.71 
 
 
656 aa  386  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
502 aa  386  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
561 aa  386  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
573 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
502 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
501 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
493 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
501 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
502 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
494 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
502 aa  380  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
494 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
533 aa  379  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
510 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
499 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
495 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
502 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
489 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  46.23 
 
 
643 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.53 
 
 
499 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
647 aa  376  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  41.24 
 
 
701 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
511 aa  373  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  40 
 
 
512 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
503 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
508 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
495 aa  369  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
577 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
511 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
504 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
489 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
501 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
501 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
503 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
502 aa  369  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
509 aa  370  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
515 aa  370  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
515 aa  370  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
512 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>