More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2647 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  221  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  70.43 
 
 
132 aa  164  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  43.93 
 
 
115 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  54.32 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
116 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  41.74 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  47.56 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  35.34 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  49.37 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  34.48 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  31.19 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  34.48 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  31.13 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  29.57 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  48.44 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  36.13 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 
305 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
249 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 
252 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  43.04 
 
 
280 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  42.53 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
269 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.63 
 
 
471 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
321 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  42.03 
 
 
284 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  44.32 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  39.6 
 
 
244 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
252 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  42.68 
 
 
251 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
244 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  38.32 
 
 
253 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  43.59 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 
245 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
321 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  28.57 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  35.14 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>