18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2638 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2638  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0006014  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1014  hypothetical protein  43.2 
 
 
218 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0531  hypothetical protein  51.72 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5263  hypothetical protein  40.91 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3695  hypothetical protein  46.01 
 
 
228 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5653  hypothetical protein  45.96 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44795  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2694  hypothetical protein  38.91 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  0.47344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2389  hypothetical protein  42.01 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.460334  normal  0.447336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6106  hypothetical protein  40.58 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4129  hypothetical protein  37.56 
 
 
233 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2204  hypothetical protein  35.02 
 
 
222 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5291  hypothetical protein  45.51 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0867  hypothetical protein  44.6 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520072  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3664  hypothetical protein  36.79 
 
 
228 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10428  normal  0.446029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0199  hypothetical protein  35.92 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.714178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1883  hypothetical protein  37.76 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.381407  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2310  hypothetical protein  42.97 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.420638  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1102  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.578838  normal  0.478034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>