More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2582 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  42.33 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  39.32 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0432  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  39.56 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.98 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  37.8 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  39.15 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.87 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  33.22 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  32.15 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  35.63 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 294 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  30.83 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  33.47 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.61 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 300 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>