74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2570 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  853    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  58.02 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  43.91 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  34.32 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  38.62 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  36.59 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  31.49 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  30.25 
 
 		 452 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  39.19 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  39.19 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  39.19 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  39.71 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  39.71 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  24.48 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  31.76 
 
 		 114 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 152 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  43.1 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  43.1 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 		 106 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 76 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 76 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 117 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.97 
 
 		 206 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 96 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.55 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  30.36 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 72 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  42.37 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 76 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 179 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 69 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  32.2 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 165 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 481 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  20.7 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 77 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 112 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 194 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  43.86 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  24.16 
 
 		 285 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 718 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 267 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 176 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 70 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 188 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  24.74 
 
 		 213 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  23.6 
 
 		 285 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>