More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2561 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  100 
 
 		 616 aa  1215    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  56.04 
 
 		 626 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  49.17 
 
 		 611 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  50.84 
 
 		 619 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  45.44 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  46.22 
 
 		 595 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  50.74 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  36.54 
 
 		 623 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  38.09 
 
 		 625 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 		 621 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 621 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  37.5 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  35.86 
 
 		 625 aa  318  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  34.79 
 
 		 631 aa  312  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 616 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  35.55 
 
 		 618 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  35.23 
 
 		 614 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  32.76 
 
 		 613 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 618 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  35.75 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  38.4 
 
 		 625 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 609 aa  296  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  34.83 
 
 		 619 aa  296  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  33.22 
 
 		 611 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  32.07 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  32.89 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  36.14 
 
 		 615 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.69 
 
 		 603 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  32.2 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.84 
 
 		 603 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.44 
 
 		 606 aa  276  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 		 600 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.4 
 
 		 618 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  35.75 
 
 		 615 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  34.8 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 626 aa  257  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.69 
 
 		 621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  34.8 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.44 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  34.91 
 
 		 638 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.7 
 
 		 605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  35.01 
 
 		 623 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.21 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  32.03 
 
 		 608 aa  239  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 611 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  31.97 
 
 		 616 aa  236  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 662 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  35.48 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.45 
 
 		 594 aa  234  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.24 
 
 		 603 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.24 
 
 		 603 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 617 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.59 
 
 		 587 aa  233  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.64 
 
 		 627 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  31.61 
 
 		 619 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.72 
 
 		 597 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.88 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  31.55 
 
 		 619 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 604 aa  217  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  25.33 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  34.33 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  37.14 
 
 		 631 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  37.19 
 
 		 582 aa  210  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  33.4 
 
 		 610 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  33.04 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  28.66 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.21 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.94 
 
 		 596 aa  208  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  29.68 
 
 		 618 aa  207  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  36.38 
 
 		 784 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40.16 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  34.31 
 
 		 728 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  35.44 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  37.16 
 
 		 665 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 596 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.37 
 
 		 595 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 596 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  34.87 
 
 		 782 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.77 
 
 		 784 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.45 
 
 		 768 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 		 586 aa  203  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.11 
 
 		 601 aa  203  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  32.73 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.71 
 
 		 580 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  36.78 
 
 		 778 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  33.06 
 
 		 814 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.66 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.77 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.37 
 
 		 673 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.31 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  33.33 
 
 		 768 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.84 
 
 		 585 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  38.68 
 
 		 705 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  34.31 
 
 		 728 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.16 
 
 		 595 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>