191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2501 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  65.17 
 
 
543 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  100 
 
 
540 aa  1085    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  53.97 
 
 
583 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  30.37 
 
 
542 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  27.84 
 
 
602 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  27.99 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  26.51 
 
 
544 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  27.4 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  30.18 
 
 
628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  27.4 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  27.2 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  27.25 
 
 
590 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  24.6 
 
 
585 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  25.75 
 
 
596 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  25.9 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  25.05 
 
 
635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  25.55 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  25.75 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  26.21 
 
 
590 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  25.25 
 
 
609 aa  123  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.25 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  28.25 
 
 
551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  25.51 
 
 
592 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  26.01 
 
 
592 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  25.65 
 
 
591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.58 
 
 
622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  25.16 
 
 
590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  25.85 
 
 
629 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  28.7 
 
 
559 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  27.55 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  26.89 
 
 
614 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  38.18 
 
 
593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  25 
 
 
599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  37.13 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  28.29 
 
 
581 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  27.53 
 
 
614 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  38.1 
 
 
628 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  26.25 
 
 
607 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.79 
 
 
614 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  27.74 
 
 
625 aa  114  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  41.36 
 
 
619 aa  114  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  35.63 
 
 
599 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  26.25 
 
 
607 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  26.25 
 
 
607 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.27 
 
 
617 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  35.98 
 
 
593 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  32.54 
 
 
1283 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  33.48 
 
 
610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  24.61 
 
 
609 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  31.44 
 
 
611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  33.78 
 
 
609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  29.96 
 
 
227 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.23 
 
 
609 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  34.23 
 
 
609 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.23 
 
 
609 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  30.4 
 
 
608 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  34.68 
 
 
609 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.23 
 
 
609 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  27.99 
 
 
544 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  32.67 
 
 
586 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  32.89 
 
 
609 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  32.89 
 
 
609 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.13 
 
 
601 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  32.89 
 
 
609 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  32.89 
 
 
611 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  24.82 
 
 
595 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  38.79 
 
 
610 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  30.13 
 
 
614 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.13 
 
 
601 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.13 
 
 
601 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  29.52 
 
 
547 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.58 
 
 
587 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  32.44 
 
 
607 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  33.33 
 
 
616 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.13 
 
 
601 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  35.76 
 
 
613 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.34 
 
 
619 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 
616 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 
546 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.53 
 
 
595 aa  107  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  33.33 
 
 
611 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.34 
 
 
599 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  33.73 
 
 
599 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  34.76 
 
 
611 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  32.85 
 
 
589 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.53 
 
 
603 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.18 
 
 
602 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.53 
 
 
591 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.53 
 
 
603 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.53 
 
 
603 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  32.53 
 
 
603 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  24.44 
 
 
629 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.53 
 
 
603 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  32.73 
 
 
610 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  32.34 
 
 
594 aa  104  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  30.56 
 
 
547 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  28.35 
 
 
639 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  29.23 
 
 
621 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  31.07 
 
 
522 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  23.78 
 
 
615 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>