49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2479 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  100 
 
 
501 aa  1001    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  53.14 
 
 
500 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  53.03 
 
 
499 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  51.48 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  50.78 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  49.62 
 
 
522 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  50.81 
 
 
500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.81 
 
 
494 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  54.04 
 
 
374 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  56.3 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  52.1 
 
 
381 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.08 
 
 
372 aa  323  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.6 
 
 
381 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  47.37 
 
 
522 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  47.86 
 
 
488 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  47.79 
 
 
368 aa  277  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.39 
 
 
378 aa  273  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  47.45 
 
 
496 aa  272  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.61 
 
 
384 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.19 
 
 
457 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.12 
 
 
380 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.96 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.87 
 
 
387 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  41.51 
 
 
344 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  38.85 
 
 
349 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  38.54 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.78 
 
 
220 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  34.84 
 
 
366 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  57.76 
 
 
727 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  32.95 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0978  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.14 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000974435  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0312  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  43.4 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  25.12 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  30.4 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  37.25 
 
 
217 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.88 
 
 
696 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.25 
 
 
800 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  23.87 
 
 
494 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 
222 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  27.23 
 
 
823 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1379  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 
201 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0301547  normal  0.108575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  27.21 
 
 
372 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  32.39 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  32.39 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  32.39 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2627  hypothetical protein  28.81 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13699  protease  32.67 
 
 
232 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0599341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.91 
 
 
235 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>