More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2451 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  100 
 
 		 472 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  73.91 
 
 		 489 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  62.45 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  62.77 
 
 		 484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  49.13 
 
 		 507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 508 aa  289  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.27 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.24 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.58 
 
 		 487 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 		 527 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.02 
 
 		 763 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5620  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000613899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  36.76 
 
 		 498 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.94 
 
 		 490 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  47.69 
 
 		 303 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 553 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 503 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 482 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.64 
 
 		 534 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 508 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0901  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 		 466 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  35.87 
 
 		 497 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 522 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.85 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 		 519 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.8 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.03 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.44 
 
 		 489 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  36.19 
 
 		 489 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 483 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  37.5 
 
 		 492 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.41 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  39.41 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  35.75 
 
 		 481 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  39.19 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.23 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 		 757 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  36.3 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.19 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 1112 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.19 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.19 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.19 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  38.5 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  35.23 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.61 
 
 		 502 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.24 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  38.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.12 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 		 519 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 788 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 500 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 		 512 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 733 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 513 aa  167  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 		 482 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>