190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2432 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 
514 aa  1003    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  74.71 
 
 
511 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  66.99 
 
 
529 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  62.95 
 
 
512 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  63.39 
 
 
530 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  60.67 
 
 
515 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  60.47 
 
 
515 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  60.47 
 
 
515 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  58.03 
 
 
510 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  56.03 
 
 
522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  57.06 
 
 
514 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  54.49 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 
537 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  34.33 
 
 
547 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  31.36 
 
 
611 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.38 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  32.19 
 
 
522 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  31.39 
 
 
498 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  28.1 
 
 
538 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  27.49 
 
 
554 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  27.49 
 
 
554 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  27.49 
 
 
554 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.89 
 
 
410 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  27.1 
 
 
411 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
532 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  26.4 
 
 
525 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 
412 aa  90.1  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.14 
 
 
558 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  49.32 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  31.11 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
597 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 
547 aa  63.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.64 
 
 
562 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  31.65 
 
 
619 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  42.42 
 
 
411 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.21 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.75 
 
 
705 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.52 
 
 
514 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.86 
 
 
555 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 
361 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  36.59 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
305 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  33.03 
 
 
375 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  46.03 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  29.47 
 
 
614 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.91 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  33.17 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  25.42 
 
 
442 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  44.87 
 
 
389 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  25.95 
 
 
435 aa  53.9  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 
504 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
564 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.48 
 
 
553 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  23.65 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  46.55 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
514 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  18.48 
 
 
518 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  38.67 
 
 
616 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.65 
 
 
485 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  32.39 
 
 
616 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.27 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  45 
 
 
650 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32.86 
 
 
501 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
563 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  32.97 
 
 
600 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  27.61 
 
 
645 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.46 
 
 
739 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  29.33 
 
 
563 aa  51.2  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  39.39 
 
 
478 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  37.84 
 
 
525 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  36.81 
 
 
561 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  26.73 
 
 
518 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  41.1 
 
 
413 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 
393 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
553 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  25.73 
 
 
627 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.66 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  26.95 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.85 
 
 
665 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  33.77 
 
 
387 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
403 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44.29 
 
 
681 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  33.63 
 
 
399 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 
413 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
516 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  45.1 
 
 
454 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 
447 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 
226 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  27.11 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 
487 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  44.29 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  27 
 
 
375 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>