26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2399 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2399  leucine rich repeat protein  100 
 
 
368 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7574  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  58.33 
 
 
385 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  30.13 
 
 
770 aa  87.4  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  28.25 
 
 
815 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  25.08 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  27.66 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  29.74 
 
 
692 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  30.55 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  26.37 
 
 
476 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  28.22 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  34.78 
 
 
254 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  30.95 
 
 
466 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  26.95 
 
 
471 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  27.18 
 
 
897 aa  56.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  32.7 
 
 
620 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  25.63 
 
 
781 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  23.61 
 
 
465 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  25.58 
 
 
807 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  27.01 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  26.22 
 
 
510 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1754  LRR-repeat protein  26 
 
 
167 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.022386 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  24 
 
 
1048 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1628  hypothetical protein  21.2 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  22.94 
 
 
591 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  39.86 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>