30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2381 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  1162    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  48.74 
 
 
619 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  46.26 
 
 
675 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  44.94 
 
 
638 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  42.72 
 
 
692 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  39.9 
 
 
654 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  39.75 
 
 
673 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  37.82 
 
 
603 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  38.71 
 
 
618 aa  323  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  31.25 
 
 
633 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  34.12 
 
 
867 aa  236  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  35.1 
 
 
651 aa  232  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  43.32 
 
 
770 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  32.42 
 
 
659 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
623 aa  202  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
616 aa  197  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  31.95 
 
 
593 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  32.35 
 
 
644 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  27.52 
 
 
624 aa  165  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  30.86 
 
 
651 aa  155  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.83 
 
 
615 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  26.35 
 
 
624 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  26.61 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  26.02 
 
 
551 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  26.64 
 
 
593 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  22.22 
 
 
580 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  25.57 
 
 
742 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.22 
 
 
1072 aa  54.3  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.43 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  28.25 
 
 
474 aa  44.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>