More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2351 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  55.7 
 
 		 624 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  54.81 
 
 		 616 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  59.9 
 
 		 656 aa  749    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  64.13 
 
 		 629 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  100 
 
 		 616 aa  1243    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  55.06 
 
 		 632 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  56.41 
 
 		 623 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  71.74 
 
 		 645 aa  886    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  53.97 
 
 		 629 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  55.21 
 
 		 629 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  54.24 
 
 		 627 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  51.22 
 
 		 657 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  55.79 
 
 		 628 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  53.16 
 
 		 655 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  49.93 
 
 		 667 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  50.47 
 
 		 629 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  50.47 
 
 		 628 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  49.92 
 
 		 651 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  48.63 
 
 		 656 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  48.76 
 
 		 641 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  49.37 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  48.66 
 
 		 639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.61 
 
 		 636 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  48.69 
 
 		 644 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  49.92 
 
 		 642 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  49.05 
 
 		 634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  46.64 
 
 		 658 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  48.04 
 
 		 649 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  47.88 
 
 		 647 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  62.38 
 
 		 700 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  48.43 
 
 		 640 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  48.43 
 
 		 640 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  48.27 
 
 		 640 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  46.22 
 
 		 648 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  48.86 
 
 		 932 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  45.47 
 
 		 652 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  38.77 
 
 		 699 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  38.15 
 
 		 718 aa  449  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.68 
 
 		 588 aa  298  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.57 
 
 		 582 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.14 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.36 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.55 
 
 		 587 aa  289  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.23 
 
 		 626 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.12 
 
 		 588 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.94 
 
 		 626 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.42 
 
 		 618 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  38.16 
 
 		 642 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.63 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.38 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40.3 
 
 		 587 aa  270  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.83 
 
 		 663 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.78 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.58 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  39.11 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.56 
 
 		 601 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.69 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.22 
 
 		 694 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.82 
 
 		 613 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  30.62 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  30.62 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.41 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.6 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.62 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  30.46 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  30.46 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  30.46 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  30.46 
 
 		 598 aa  256  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.16 
 
 		 605 aa  256  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.19 
 
 		 638 aa  256  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  30.63 
 
 		 598 aa  256  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  30.63 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.05 
 
 		 655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  30.26 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  34.42 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  38.5 
 
 		 666 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  30.23 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.24 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  38.19 
 
 		 655 aa  251  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.52 
 
 		 564 aa  250  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.14 
 
 		 660 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  33.33 
 
 		 590 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.82 
 
 		 652 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.73 
 
 		 592 aa  249  9e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.66 
 
 		 592 aa  249  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  38.03 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  31.79 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.22 
 
 		 663 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.77 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  38.26 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.05 
 
 		 651 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.64 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  35.18 
 
 		 567 aa  247  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  29.71 
 
 		 590 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.29 
 
 		 640 aa  247  4.9999999999999997e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  34.84 
 
 		 587 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.79 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  35.38 
 
 		 636 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.03 
 
 		 619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.68 
 
 		 614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>