242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2321 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.32 
 
 
307 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.87 
 
 
309 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.79 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
306 aa  254  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.85 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.08 
 
 
352 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.08 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.82 
 
 
301 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 
318 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 
325 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.08 
 
 
313 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 
276 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 
309 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
316 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.97 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
317 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
321 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 
329 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
329 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
300 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.59 
 
 
329 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
318 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
319 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.79 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 
319 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
337 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
340 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
340 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
321 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  31.65 
 
 
332 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  31.65 
 
 
345 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  31.65 
 
 
345 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.65 
 
 
345 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.65 
 
 
345 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  31.65 
 
 
345 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.54 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
318 aa  99.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
328 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
332 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  28.38 
 
 
370 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
344 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  28.08 
 
 
332 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.9 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.51 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  29.08 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  21.64 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.85 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.54 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
287 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.03 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  23.95 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  26.34 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.54 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  25.46 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>