134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2313 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  100 
 
 
427 aa  866    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  55.02 
 
 
448 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  54.2 
 
 
437 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.04 
 
 
449 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  53.35 
 
 
418 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  53.05 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  50.12 
 
 
418 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  50.61 
 
 
430 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.43 
 
 
417 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.12 
 
 
462 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.58 
 
 
429 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  49.64 
 
 
413 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  50.48 
 
 
421 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  51.31 
 
 
423 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  49.51 
 
 
421 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  47.17 
 
 
446 aa  348  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  27.95 
 
 
437 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  28.21 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  30.73 
 
 
425 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  29.21 
 
 
429 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  31.11 
 
 
441 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  28.54 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  26.8 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  27.5 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
437 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  29.02 
 
 
473 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  30.61 
 
 
437 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  26.4 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  26.4 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  26.4 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  26.44 
 
 
438 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  25.96 
 
 
434 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  25.73 
 
 
437 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  28.47 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  30.97 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  31.76 
 
 
437 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  31.32 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  27.34 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  29.17 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  28.57 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  28.38 
 
 
433 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  26.65 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  29.14 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  28.8 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  28.8 
 
 
438 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  27.59 
 
 
415 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  27.94 
 
 
424 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  28.34 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.82 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  29.14 
 
 
432 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.64 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  27.89 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.65 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  29.62 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  27.74 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  29.95 
 
 
437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.4 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  27.82 
 
 
470 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  27.95 
 
 
440 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  25.69 
 
 
445 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  28.82 
 
 
475 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  27.27 
 
 
466 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  23.04 
 
 
478 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  36.07 
 
 
447 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.62 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  33.15 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  30.54 
 
 
574 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  32.22 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.07 
 
 
761 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  29.61 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  26.8 
 
 
483 aa  67  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  28.42 
 
 
366 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  29.38 
 
 
452 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  27.78 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  27.78 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.01 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.96 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  30.6 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.96 
 
 
490 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  27.38 
 
 
468 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.96 
 
 
478 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.96 
 
 
478 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  22.96 
 
 
471 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
463 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  26.67 
 
 
476 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 
472 aa  53.5  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  22.96 
 
 
478 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.56 
 
 
478 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  20.39 
 
 
478 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.22 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  25.64 
 
 
481 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>