213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2311 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 399 aa  774    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  46.92 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 354 aa  97.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  40.72 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  41.9 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  44.19 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  51.47 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  41.51 
 
 		 274 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  41.82 
 
 		 274 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  51.39 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  51.47 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.18 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  34.21 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.78 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  21.9 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  23.13 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.1 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  26.96 
 
 		 254 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  49.09 
 
 		 178 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  33.87 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 257 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 289 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  21.7 
 
 		 267 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  53.5  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.09 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.45 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 261 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 274 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 303 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.51 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0003  DNA polymerase III, beta subunit  23.55 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000559768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  31.4 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  23.64 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  47.89 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  47.37 
 
 		 224 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  33.7 
 
 		 286 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  43.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 276 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 276 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  29.03 
 
 		 276 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  42.86 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  25.71 
 
 		 269 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  25.24 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  20.39 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  20 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.1 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  24.35 
 
 		 254 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.44 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  22.11 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.11 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 148 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_248  DNA polymerase III domain protein  34.25 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.864877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>