More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2296 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
160 aa  319  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  77.07 
 
 
156 aa  236  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  73.89 
 
 
156 aa  223  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  69.23 
 
 
162 aa  207  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  66.24 
 
 
164 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  64.52 
 
 
155 aa  200  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  59.63 
 
 
157 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  60.78 
 
 
178 aa  187  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  60.78 
 
 
184 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  65.81 
 
 
186 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  60.78 
 
 
177 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  60.78 
 
 
177 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  59.12 
 
 
170 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  60.78 
 
 
177 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  61.39 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  63.92 
 
 
153 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  64.05 
 
 
157 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  59.24 
 
 
156 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  61.04 
 
 
149 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  59.09 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  61.88 
 
 
153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  60.78 
 
 
150 aa  177  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  57.05 
 
 
183 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  60.78 
 
 
157 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  58.17 
 
 
151 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  57.79 
 
 
187 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  64.05 
 
 
150 aa  174  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  61.44 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  55.41 
 
 
188 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  60.39 
 
 
173 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  57.14 
 
 
201 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  57.79 
 
 
159 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  50.32 
 
 
186 aa  152  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  50.98 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  56.96 
 
 
179 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  55.62 
 
 
153 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  48.41 
 
 
182 aa  140  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.29 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  39.87 
 
 
181 aa  100  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  39.13 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  42.86 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  39.32 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.49 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
446 aa  91.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  41.06 
 
 
301 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  38.66 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  38.66 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.68 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  39.5 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  40 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  41.13 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.86 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.86 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.86 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.86 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.86 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.86 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.29 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.62 
 
 
152 aa  87  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  42.5 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  43.48 
 
 
193 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
161 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.43 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  32.28 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.86 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  36.5 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  37.01 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  41.18 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  39.67 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  35.96 
 
 
189 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  35.71 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  38.76 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.06 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  41.79 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  32.48 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  36.99 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  34.19 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  41.07 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  37.01 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  31.36 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  38.26 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  43.75 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  37.93 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1642  protein of unknown function UPF0054  40.65 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208313  hitchhiker  0.00194767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  38.66 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  41.03 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  34.03 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  40.17 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  38.66 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  38.98 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  31.91 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  33.9 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  35.34 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  35.62 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>