More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2228 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  100 
 
 
379 aa  757    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  58.89 
 
 
377 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  43.55 
 
 
368 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  45.76 
 
 
375 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  38.81 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  39.08 
 
 
383 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  37.84 
 
 
380 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  29.17 
 
 
373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  32.32 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 
372 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  31.36 
 
 
374 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  31.07 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  32.05 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  29.86 
 
 
369 aa  162  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  26.74 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  30.84 
 
 
362 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.54 
 
 
377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  27.51 
 
 
372 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  34.31 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  28.19 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  26.2 
 
 
356 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  26.41 
 
 
404 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  32.92 
 
 
396 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  32.21 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  29.92 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  35.16 
 
 
374 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  31.3 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  28.08 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  29.1 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  29.32 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  28.95 
 
 
392 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  29.67 
 
 
391 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.76 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.75 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  36.22 
 
 
397 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  31.46 
 
 
400 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  31.67 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  32.24 
 
 
399 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  28.23 
 
 
385 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 
388 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.95 
 
 
393 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  33.18 
 
 
382 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.9 
 
 
398 aa  106  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  31.35 
 
 
382 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  34.5 
 
 
395 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.45 
 
 
387 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  30.24 
 
 
380 aa  106  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  35.81 
 
 
382 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  31.25 
 
 
389 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  27.8 
 
 
387 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  35.68 
 
 
382 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  33.96 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  29.82 
 
 
395 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  29.82 
 
 
395 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  29.82 
 
 
395 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 
385 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  31 
 
 
400 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  35.68 
 
 
382 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  34.42 
 
 
382 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 
400 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 
400 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
384 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  29.84 
 
 
391 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  30.59 
 
 
401 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  28.98 
 
 
383 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  26.24 
 
 
380 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
381 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  30.1 
 
 
373 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  28.48 
 
 
397 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
400 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  30.79 
 
 
387 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  33.78 
 
 
391 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  32.11 
 
 
402 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.44 
 
 
409 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  31.9 
 
 
390 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 
404 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.96 
 
 
392 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  29.33 
 
 
367 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  33.96 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  33.96 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  23.92 
 
 
380 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 
402 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  33.49 
 
 
382 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  31.07 
 
 
403 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  30.57 
 
 
391 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  28.44 
 
 
396 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
400 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  29.77 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  27.36 
 
 
393 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 
373 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  29.19 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  30.97 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 
373 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  28.43 
 
 
389 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 
385 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  34.85 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  33.87 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>