81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2156 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  68.06 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  65.22 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  63.5 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  56.39 
 
 		 182 aa  135  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 180 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  48.85 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  38.13 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  52.22 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 179 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  47.22 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  47.47 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  39.53 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.67 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  33.63 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.89 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  34.82 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  30.84 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 145 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 352 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  26.73 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.09 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.09 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.09 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.09 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.09 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 189 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>