More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2120 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  74.16 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  74.39 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  66.32 
 
 		 293 aa  364  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  65.05 
 
 		 295 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  61.67 
 
 		 299 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  60.34 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  59.32 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  59.09 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  59.93 
 
 		 305 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  58.28 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  54.98 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  58.5 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  54.74 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  57 
 
 		 327 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  54.83 
 
 		 297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  57.2 
 
 		 298 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  55.71 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  55.71 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  55.09 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  55.71 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  52.33 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  53.19 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  52.98 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  53.74 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  52.96 
 
 		 343 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  55.52 
 
 		 307 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  52.69 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  52.6 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  55.4 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  48.96 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  51.57 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  55.04 
 
 		 327 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  48.32 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.74 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 333 aa  218  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  48.94 
 
 		 367 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  41.72 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  46.59 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 291 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  42.69 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  47.39 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  49 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  46.95 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  41.57 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  38.28 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  47.69 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  47.66 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  45.87 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  40.88 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  45.27 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  44.28 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  46.98 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0789  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  43.92 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  41.16 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  42.45 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  44.24 
 
 		 225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  45.53 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  47.22 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  44.86 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  37.36 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  42.92 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  43.3 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  39.29 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  45.54 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  39.47 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  36.21 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  40.16 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  42.2 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  41.73 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  39.24 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  45.53 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  36.21 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  46.01 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  39.51 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3547  tRNA pseudouridine synthase B  44.6 
 
 		 228 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  41.78 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2801  tRNA pseudouridine synthase B  48.02 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  39.07 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>