103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2078 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  100 
 
 
840 aa  1690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.33 
 
 
911 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.73 
 
 
887 aa  190  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 
862 aa  164  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  25.53 
 
 
858 aa  159  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.46 
 
 
852 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  26.74 
 
 
871 aa  148  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  32.23 
 
 
816 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.8 
 
 
837 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.6 
 
 
1057 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.74 
 
 
834 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.11 
 
 
848 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.27 
 
 
848 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.76 
 
 
829 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  30.03 
 
 
823 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.59 
 
 
845 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.48 
 
 
860 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.11 
 
 
850 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.92 
 
 
885 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  24.86 
 
 
836 aa  127  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.33 
 
 
863 aa  126  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.58 
 
 
831 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.96 
 
 
942 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  28.95 
 
 
932 aa  101  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  23.64 
 
 
906 aa  95.1  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.37 
 
 
874 aa  92.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.52 
 
 
923 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.55 
 
 
910 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  30.98 
 
 
931 aa  78.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.05 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.42 
 
 
615 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.55 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.56 
 
 
606 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.56 
 
 
606 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.85 
 
 
612 aa  65.1  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.84 
 
 
631 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.27 
 
 
506 aa  61.2  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  27.31 
 
 
923 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  29.57 
 
 
1247 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  26.22 
 
 
575 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.92 
 
 
619 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2764  hypothetical protein  41.12 
 
 
425 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.949617 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
541 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  21.71 
 
 
983 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.35 
 
 
384 aa  54.7  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.56 
 
 
609 aa  54.7  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.34 
 
 
683 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  26.97 
 
 
379 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.72 
 
 
683 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.04 
 
 
497 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  22.22 
 
 
615 aa  52.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  34.26 
 
 
392 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.22 
 
 
627 aa  52.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.66 
 
 
599 aa  51.6  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.1 
 
 
684 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.13 
 
 
683 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  23.83 
 
 
592 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  51.6  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.6 
 
 
659 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.86 
 
 
361 aa  51.2  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  42.86 
 
 
425 aa  51.2  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  31.97 
 
 
351 aa  51.2  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.6 
 
 
658 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30.77 
 
 
375 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2239  hypothetical protein  35.06 
 
 
453 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.11 
 
 
585 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  30.39 
 
 
490 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.56 
 
 
577 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  27.63 
 
 
375 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.55 
 
 
375 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  30.58 
 
 
576 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.55 
 
 
375 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.16 
 
 
375 aa  48.9  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.84 
 
 
580 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.69 
 
 
378 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.28 
 
 
665 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.53 
 
 
375 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.68 
 
 
375 aa  48.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.69 
 
 
383 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  25.98 
 
 
634 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.15 
 
 
627 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  30.69 
 
 
375 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
378 aa  47.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.27 
 
 
375 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.27 
 
 
375 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.73 
 
 
375 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.16 
 
 
374 aa  46.2  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.92 
 
 
634 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.67 
 
 
581 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.77 
 
 
383 aa  45.8  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.56 
 
 
262 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.95 
 
 
375 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  22.9 
 
 
570 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  29.73 
 
 
375 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.16 
 
 
376 aa  45.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.73 
 
 
375 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.15 
 
 
663 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 
581 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  28.57 
 
 
490 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.03 
 
 
375 aa  44.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>