More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2055 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  66.48 
 
 		 183 aa  264  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  51.67 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  46.86 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 		 197 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  46.32 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 200 aa  168  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 208 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.02 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 205 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23.83 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
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NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
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