More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2026 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  55.93 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  58.41 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  54.7 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  43.7 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  45.13 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  35.34 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  41.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  46.59 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  44.21 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  31.03 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  47.83 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 234 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  39.22 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  42.67 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.73 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.76 
 
 		 259 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.63 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.88 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 354 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 339 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 342 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 320 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  35.21 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>