71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1938 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  100 
 
 
487 aa  971    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  31.01 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  30.9 
 
 
563 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  30.9 
 
 
559 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  31.41 
 
 
563 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  30.9 
 
 
559 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  30.9 
 
 
563 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  30.9 
 
 
563 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  30.9 
 
 
540 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  32.41 
 
 
833 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  32.92 
 
 
480 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  29.67 
 
 
718 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 
383 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  29.15 
 
 
1164 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 
382 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  31.13 
 
 
1138 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  25.26 
 
 
686 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  29.82 
 
 
1174 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  28.22 
 
 
642 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  34.18 
 
 
652 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
1327 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  27.03 
 
 
921 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  25.57 
 
 
625 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  24.83 
 
 
644 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  25.25 
 
 
625 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  30.41 
 
 
929 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  28.9 
 
 
913 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  29.3 
 
 
1426 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  27.82 
 
 
1118 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
1421 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  24.4 
 
 
660 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  44.05 
 
 
331 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  28.22 
 
 
605 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  28.66 
 
 
952 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  27.53 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.15 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  38.37 
 
 
345 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  44.19 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  30.07 
 
 
756 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  40.48 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.98 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  25 
 
 
877 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 
303 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  25.83 
 
 
561 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  44.93 
 
 
249 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  29.11 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  23.03 
 
 
603 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  24.1 
 
 
553 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  24.91 
 
 
589 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  35.87 
 
 
215 aa  57  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  36.36 
 
 
346 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  33 
 
 
986 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  31.82 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  34.52 
 
 
747 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  25.54 
 
 
259 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  25 
 
 
583 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  40.48 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  30.84 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  36.79 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 
338 aa  51.2  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 
646 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  26.41 
 
 
528 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  36.76 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  34.52 
 
 
336 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  24.21 
 
 
553 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  24.79 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  33.82 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  27.69 
 
 
338 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  34.92 
 
 
293 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>