84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1934 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  47.35 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  50.27 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  46.09 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  40.78 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  40.68 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  45.01 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  40.22 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  41.85 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  42.46 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  36.32 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  40.41 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  25.35 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  24.93 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  25.49 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  26.05 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  26.05 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  24.93 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  27.82 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  24.72 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  24.86 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  25.99 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  25.99 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  26.06 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  26.06 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  21.81 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  25.82 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  21.19 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  24.65 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  24.65 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  23.8 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.58 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  25.14 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.11 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  35.16 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.99 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  29.53 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 405 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.78 
 
 		 805 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  32.73 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 838 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.89 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.89 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.89 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.89 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 		 416 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 840 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 386 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 848 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 822 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.22 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.53 
 
 		 835 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  33.1 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 873 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.73 
 
 		 841 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3628  lipoprotein ABC transporter, permease  25.98 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  30.72 
 
 		 804 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  28.74 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.41 
 
 		 802 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.46 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 822 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 871 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  26.39 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  34.78 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  30.87 
 
 		 380 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  37.11 
 
 		 805 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  32.12 
 
 		 408 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>