More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1786 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  70.54 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  67.86 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 113 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 113 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  60.71 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  57.55 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  58.93 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  54.46 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>