35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1713 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 472 aa  947    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  60.17 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  30.44 
 
 		 553 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  30.44 
 
 		 553 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  30.22 
 
 		 490 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  24.84 
 
 		 661 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  34.11 
 
 		 618 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  33.5 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  30.53 
 
 		 632 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  29.58 
 
 		 612 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  30.3 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.6 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  21.67 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  25.58 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  24.9 
 
 		 742 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  19.52 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  24.24 
 
 		 672 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  28.25 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  19.28 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03013  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08820)  23.36 
 
 		 763 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55209  predicted protein  24.23 
 
 		 912 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  27.64 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02490  cytoplasm protein, putative  24.37 
 
 		 851 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25 
 
 		 601 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.12 
 
 		 673 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.37 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  36.23 
 
 		 681 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  24.24 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  28.4 
 
 		 691 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>