256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1704 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  100 
 
 
310 aa  610  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  53.9 
 
 
301 aa  288  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  45.16 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  42.86 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  40.92 
 
 
320 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  43.23 
 
 
326 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  39.88 
 
 
312 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  44.9 
 
 
309 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  39.74 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  37.12 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  39.2 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  37.3 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  41.06 
 
 
321 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  43.18 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  39.18 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  42.29 
 
 
331 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  35.38 
 
 
314 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  40.82 
 
 
329 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  36.77 
 
 
298 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  37.33 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  37.33 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  37.33 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  35.81 
 
 
297 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  38.91 
 
 
323 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  35.48 
 
 
304 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  41.67 
 
 
333 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  41.83 
 
 
310 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.16 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  34.89 
 
 
339 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  35.32 
 
 
334 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  35.34 
 
 
346 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  39.71 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  36.93 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  38.83 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  34.21 
 
 
299 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
324 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  28.81 
 
 
293 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  28.62 
 
 
293 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  28.96 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  28.81 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  29.67 
 
 
282 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  30.38 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  27.76 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  31.47 
 
 
287 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  31.77 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.95 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  32.71 
 
 
235 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.01 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  31.23 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  25.41 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  28.72 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  24.49 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.26 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  29.28 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  26.51 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  25.68 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  29.37 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.51 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  27.8 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  27.18 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  26.69 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  27.18 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  25.77 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  28.28 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  25.34 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  28.16 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  26.48 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  28.88 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  30.69 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  26.18 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  28.67 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  28.52 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.18 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  27.04 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  27.96 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.27 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  24.92 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  26.25 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  29.82 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  24.65 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  27.76 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  25 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  25.53 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  30.41 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  29.39 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.02 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  29.39 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  29.39 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  24.6 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  27.21 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  25.09 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  28.67 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  25.09 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  27.5 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  29.39 
 
 
918 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  27.81 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  27.81 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  25.18 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  29.23 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>