More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1679 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
426 aa  821    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  47.69 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  46.72 
 
 
381 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  55.92 
 
 
423 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
404 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
420 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  45.41 
 
 
383 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  45.75 
 
 
439 aa  166  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  42.61 
 
 
399 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  42.73 
 
 
369 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
418 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
393 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  48.85 
 
 
400 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  43.07 
 
 
364 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
434 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  37.19 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 
390 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  42.2 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
389 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.76 
 
 
786 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.08 
 
 
458 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
408 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.26 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 
398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  42.72 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  41.33 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.39 
 
 
726 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
404 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  41.09 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.9 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  40.71 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  34.88 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  34.88 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.87 
 
 
581 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
404 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  34.63 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  34.63 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  35.61 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  44.38 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
376 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  34.95 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
372 aa  113  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.67 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.97 
 
 
699 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
399 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
407 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  36.67 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  34.78 
 
 
359 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
363 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
359 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  36.61 
 
 
402 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
359 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
359 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  31.53 
 
 
359 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
359 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
234 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.21 
 
 
380 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.29 
 
 
382 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
359 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
359 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.49 
 
 
354 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  36.53 
 
 
611 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.82 
 
 
401 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
440 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  33.15 
 
 
380 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
363 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  31.87 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.33 
 
 
442 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
612 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  36.59 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.22 
 
 
400 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  32.37 
 
 
392 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.58 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25.51 
 
 
364 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
382 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
421 aa  94  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.74 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
445 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
468 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.06 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  30.74 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  30.88 
 
 
462 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
425 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
387 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  26.04 
 
 
363 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>