More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1562 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  32.95 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  34.43 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.56 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  49.09 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  33.56 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  43.33 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  45.76 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  36.78 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  38.98 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 461 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>